DESIPE é o departamento responsável pelo gerenciamento das unidades prisionais e seus servidores, sendo as unidades:
- Penitenciária Agrícola de Monte Cristo – PAMC
- Cadeia Pública Feminina de Boa Vista – CPFBV
- Divisão de Segurança e Captura – DICAP
- Centro de Progressão Penitenciária – CPP
- Cadeia Pública Masculina de Boa Vista – CPBV